分公司没有合同也要报印花税，对于企业集团内具有平等法律地位的主体之间自愿订立、明确双方购销关系、据以供货和结算、具有合同性质的凭证，应按规定征收印花税。
《中华人民共和国印花税暂行条例》第二条，下列凭证为应纳税凭证：
（一）购销、加工承揽、建设工程承包、财产租赁、货物运输、仓储保管、借款、财产保险、技术合同或者具有合同性质的凭证；
（二）产权转移书据；
（三）营业账簿；
（四）权利、许可证照；
（五）经财政部确定征税的其他凭证。
甲公司设立了分公司，分公司在运营过程中未签订合同，但存在实际的业务往来和交易凭证。税务机关在检查中认定分公司需缴纳印花税，甲公司对此表示不解，认为没有合同不应缴纳印花税。但经过税务机关依据相关法律法规的解释和说明，甲公司最终接受并依法缴纳了印花税。
乙集团公司旗下有多个分公司，这些分公司之间有业务合作但未订立合同，税务部门根据企业实际情况，按照具有合同性质的凭证对其征收印花税，各分公司在了解相关规定后也依法履行了纳税义务。
在这个问题上，企业需要明确印花税的征收范围并严格遵守。虽然分公司可能没有正式的合同，但只要有具备合同性质的凭证来明确双方的购销关系等，就应当依法缴纳印花税。这也提醒企业在经营过程中要准确理解和把握税收法规，避免因对法规的误解而产生不必要的税务风险。同时，税务机关在征税过程中，应确保依据充分且解释清晰，保障企业的合法权益。企业若对征税存在异议，应通过合法途径进行申诉和沟通，以维护自身权益和税收秩序的公正公平。
