通过运行黑客软件非法攻击他人服务器，构成破坏计算机系统罪。
《刑法》第二百八十六条，违反国家规定，对计算机信息系统功能进行删除、修改、增加、干扰，造成计算机信息系统不能正常运行，后果严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处五年以上有期徒刑。
故意制作、传播计算机病毒等破坏性程序，影响计算机系统正常运行，后果严重的，依照第一款的规定处罚。
刑事辩护
通过运行黑客软件非法攻击他人服务器能否构成破坏计算机系统罪
通过运行黑客软件非法攻击他人服务器，构成破坏计算机系统罪。【法律依据】《刑法》第二百八十六条，违反国家规定，对计算机信息系统功能进行删除、修改、增加、干扰，造成计算机信息系统不能正常运行，后果严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处五年以上有期徒刑。故意制作、传播计算机病毒等破坏性程序，影响计算机系统正常运行，后果严重的，依照第一款的规定处罚。
案例一：张某利用黑客软件对多家企业的服务器进行攻击，导致这些服务器长时间瘫痪，企业业务遭受重大损失。最终张某被依法追究刑事责任，以破坏计算机系统罪被判刑。
案例二：李某通过运行黑客软件攻击某政府部门的服务器，严重影响了政府部门的正常办公和信息系统的运行。李某也因此被以破坏计算机系统罪定罪处罚。
在这类案件中，关键在于对行为的认定和后果的评估。运行黑客软件攻击他人服务器的行为明显违反了国家规定，且对计算机信息系统的正常运行造成了严重干扰和破坏。从案例中可以看出，无论攻击的对象是企业还是政府部门，只要达到法律规定的后果严重程度，就会被依法追究刑事责任。同时，这也提醒人们要严格遵守法律法规，不得利用技术手段进行非法活动，否则必将面临法律的制裁。
