妨害传染病防治罪立案标准如下：
(一)供水单元供应的饮用水不符合国家规定的卫生标准的；
(二)拒绝按照疾病预防控制机构提出的卫生要求，对传染病病原体污染的污水、污物、粪便进行消毒处理的；
(三)准许或者纵容传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人从事国务院卫生行政部门规定禁止从事的易使该传染病扩散的工作的；
(四)拒绝执行疾病预防控制机构遵照传染病防治法提出的预防、控制措施的。
《刑法》第三百三十条，违反传染病防治法的规定，有下列情形之一，引起甲类传染病以及依法确定采取甲类传染病预防、控制措施的传染病传播或者有传播严重危险的，处三年以下有期徒刑或者拘役；后果特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑：
（一）供水单位供应的饮用水不符合国家规定的卫生标准的；
（二）拒绝按照疾病预防控制机构提出的卫生要求，对传染病病原体污染的污水、污物、场所和物品进行消毒处理的；
（三）准许或者纵容传染病病人、病原携带者和疑似传染病病人从事国务院卫生行政部门规定禁止从事的易使该传染病扩散的工作的；
（四）出售、运输疫区中被传染病病原体污染或者可能被传染病病原体污染的物品，未进行消毒处理的；
（五）拒绝执行县级以上人民政府、疾病预防控制机构依照传染病防治法提出的预防、控制措施的。
单位犯前款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照前款的规定处罚。
甲类传染病的范围，依照《中华人民共和国传染病防治法》和国务院有关规定确定。
案例一：在某地区爆发传染病期间，一家企业无视疾病预防控制机构提出的对其场所进行消毒处理的要求，导致传染病出现一定范围的传播。最终该企业相关负责人被依法追究刑事责任。
案例二：某供水单位长期供应不符合国家规定卫生标准的饮用水，在传染病流行期间仍未整改，造成传染病的进一步扩散，相关责任人被依法逮捕。
在这些案例中，可以明显看出行为人的行为完全符合妨害传染病防治罪的构成要件。对于此类犯罪，必须严格依法惩处，以维护社会公共卫生安全和公众的健康权益。同时也提醒广大单位和个人，在传染病防治期间，一定要严格遵守相关法律法规和卫生要求，切勿抱有侥幸心理，否则将面临严重的法律后果。对于司法机关来说，应当准确把握立案标准和法律适用，确保公正司法，切实保障人民群众的生命安全和身体健康。
