专利侵权纠纷的处理：
1、协商与和解：专利权人和被控侵权人均可自行协商或在其他第三方的调解、斡旋下达成和解协议，解决纠纷。提出协商意向时一般可以向侵权方发送侵权警告函。这在我国专利法中并无规定，但在现实生活中却被经常使用，而且还常取到较好的作用。
2、行政裁决或协调：专利权人在侵权人侵权事实和证据充分确凿的情况下，可向专利局等有关行政部门举报，由其采取行政措施，对侵权人的侵权行为进行调查核实后作出行政处罚。在行政裁决过程中，有关专利行政部门基于有关当事人的申请，可对专利侵权的民事责任进行调解。
3、向法院起诉：专利权人在发现侵权人侵犯其专利权后，可以向侵权行为地、被告所在地等相关人民法院提起民事诉讼，要求停止侵权行为赔偿经济损失等。同时有权申请对侵权人的侵权事实和证据进行诉讼保全，申请法院强制令，禁止侵权人继续侵权行为。
《专利法》第七十四条，侵犯专利权的诉讼时效为三年，自专利权人或者利害关系人知道或者应当知道侵权行为以及侵权人之日起计算。
发明专利申请公布后至专利权授予前使用该发明未支付适当使用费的，专利权人要求支付使用费的诉讼时效为三年，自专利权人知道或者应当知道他人使用其发明之日起计算，但是，专利权人于专利权授予之日前即已知道或者应当知道的，自专利权授予之日起计算。
甲公司拥有一项关键专利技术，发现乙公司未经许可使用该技术生产产品。甲公司先向乙公司发送侵权警告函，随后双方进行协商，最终达成和解协议，乙公司支付了相应的专利使用费。
丙公司的专利被丁公司侵犯，在证据确凿的情况下，丙公司向专利局举报，专利局经过调查核实对丁公司作出行政处罚，并对双方的民事责任进行了调解。
在专利侵权纠纷中，不同的处理方式都有其特点和适用场景。协商与和解能够快速高效地解决纠纷，节省双方的时间和成本，也有利于维护商业合作关系。行政裁决或协调则借助行政部门的力量，能及时有效地制止侵权行为。而向法院起诉则是较为有力的法律手段，能切实保障专利权人的合法权益。但无论选择哪种方式，都需要专利权人及时行动，固定证据，依法依规进行处理，以维护自身的知识产权。同时，侵权方也应该尊重他人的知识产权，避免陷入法律纠纷，否则可能面临严重的法律后果。
