合同原件被销毁复印件是有效的，但是需要结合其他证据认定。合同原件被销毁，只有复印件的，对合同的成立不产生影响，合同仍成立的。
但是如果因履行合同产生纠纷而需向法院起诉时，根据证据举证规则，如果对方对合同复印件不认可的，因不能提供合同原件，会对其主张权利产生不利影响。
《民法典》第五百零二条，依法成立的合同，自成立时生效，但是法律另有规定或者当事人另有约定的除外。
依照法律、行政法规的规定，合同应当办理批准等手续的，依照其规定。未办理批准等手续影响合同生效的，不影响合同中履行报批等义务条款以及相关条款的效力。应当办理申请批准等手续的当事人未履行义务的，对方可以请求其承担违反该义务的责任。
依照法律、行政法规的规定，合同的变更、转让、解除等情形应当办理批准等手续的，适用前款规定。
王某与李某签订了一份合同，之后王某不慎将合同原件丢失，仅剩下合同复印件。在合同履行过程中双方产生争议，王某诉至法院。李某对合同复印件提出质疑，而王某又无法提供合同原件，导致其在诉讼中处于较为被动的局面。
另一个案例是，张某与陈某的合同原件被意外损毁，只有复印件留存。在纠纷发生时，张某通过收集其他相关证据形成证据链，对合同复印件进行了有力的佐证，最终使得法院认可了合同复印件的效力。
在实际的法律事务中，当遇到合同原件被销毁而仅有复印件的情况，当事人需谨慎对待。一方面，要尽可能寻找其他关联证据来加强对合同复印件效力的证明，比如相关的往来邮件、短信记录、证人证言等。另一方面，在签订合同时就应当意识到原件保管的重要性，做好妥善的保管措施，以避免日后可能出现的麻烦。如果因不可预见的原因导致原件丢失或销毁，应及时采取措施补救，通过合法途径维护自己的权益。同时，对方如果对合同复印件存在异议，也应理性对待，不能一概而论地否定，而需根据具体情况和证据进行综合判断。
