认定拆迁补偿合同无效方式是当事人无民事行为能力;不是其真实意思表示;违反法律强制性和公序良俗的，不具有法律效力。
《中华人民共和国民法典》第一百四十六条
行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为无效。
《中华人民共和国民法典》第一百五十三条
违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。但是，该强制性规定不导致该民事法律行为无效的除外。违背公序良俗的民事法律行为无效。
拆迁补偿合同违约金的计算是应当以违约金超过造成的损失30%为标准适当减少计算，瑞律提醒您，一般情况下合同中有违约金的规定就按合同中的计算，如果合同中没有明确违约金的制定，就按超过造成的损失30%为标准适当减少计算。
《中华人民共和国民法典》第五百八十五条【违约金】当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加;约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。
拆迁补偿协议无效，需要重新协商补偿，或者依法进行评估补偿。我国法律规定，人民法院判决确认违法或者无效的，可以同时判决责令被告采取补救措施；给原告造成损失的，依法判决被告承担赔偿责任。
