民事纠纷不会留案底。民事纠纷只是在派出所留有问询记录或调解记录；留有案底的是属于刑事案件；民事纠纷如果上升到刑事案件就要留案底。民事纠纷，是指平等主体之间发生的，以民事权利义务为内容的社会纠纷（可处分性的）。民事纠纷作为法律纠纷的一种，一般来说，是因为违反了民事法律规范而引起的。民事主体违反了民事法律义务规范而侵害了他人的民事权利，由此而产生以民事权利义务为内容的民事争议。总的来讲，民事纠纷就是处理平等主体间人身关系和财产关系的法律规范的总和，所以不会留案底。
二、民事案件可以拘留吗可以，因民事纠纷产生民事诉讼的，诉讼当事人可能被司法拘留。如果拒不履行民事判决、裁定，涉嫌犯罪的，可能被刑事拘留。司法拘留是一种惩罚措施，刑事拘留是一种强制措施。www.ruilaw.cn
三、民事纠纷拘留多长时间一般只有在行为比较严重的时候法院才会进行民事拘留，民事拘留的时间法律也有具体的规定，不得超过十五日，表现好的话也可以提前结束。
民事拘留情形有以下几点：伪造、毁灭重要证据，妨碍人民法院审理案件的;以暴力、威胁、贿买方法阻止证人作证或者指使、贿买、胁迫他人作伪证的;隐藏、转移、变卖、毁损已被查封、扣押的财产，或者已被清点并责令其保管的财产，转移已被冻结的财产的;对司法工作人员、诉讼参加人、证人、翻译人员、鉴定人、勘验人、协助执行的人，进行侮辱、诽谤、诬陷、殴打或者打击报复的;以暴力、威胁或者其他方法阻碍司法工作人员执行职务的;拒不履行人民法院已经发生法律效力的判决、裁定的;当事人之间恶意串通，企图通过诉讼、调解等方式侵害他人合法权益的，人民法院应当驳回其请求，并根据情节轻重予以罚款、拘留;被执行人与他人恶意串通，通过诉讼、仲裁、调解等方式逃避履行法律文书确定的义务的，人民法院应当根据情节轻重予以罚款、拘留。
