公司公积金办理流程是：公司根据职工名册办理个人开户，合计出需缴存的公积金总数到公积金中心指定银行交费，或者携带职工公积金转入通知书填写公积金变更清册、公积金汇缴书交缴公积金。
法律依据
《《住房公积金管理条例》》第十五条单位录用职工的，应当自录用之日起30日内到住房公积金管理中心办理缴存登记，并持住房公积金管理中心的审核文件，到受委托银行办理职工住房公积金账户的设立或者转移手续。单位与职工终止劳动关系的，单位应当自劳动关系终止之日起30日内到住房公积金管理中心办理变更登记，并持住房公积金管理中心的审核文件，到受委托银行办理职工住房公积金账户转移或者封存手续。
