首先，是独立费扣减的问题。
施工中工程量取消的实体项目，施工单位在结算时只以独立费形式扣减实体项目的价款，比如柱梁板混凝土项目的取消，往往不愿主动扣减模板摊销费用和以人工费、机械费为计算基数的措施费和规费。
其次，是人工费和机械费的让利问题施工单位投标时对人工费和机械费在合理的范围内也进行了让利，而审计有时仅仅关注了材料价格、管理费和利润的让利幅度，忽略了对其人工费和机械费的让利审查。
比如该工程的装饰工程，施工单位在投标时对人工费和机械费分别让利了10%、35%，那么在结算审计时对变更项目的重新组价也同样要执行人工费和机械费的让利幅度。
再次，是人工费的调整问题。对材料费和机械费的调价原则和幅度合同文件往往都给予了明确的规定，但人工费的调整往往难以预料。
因此，在合同中的表述一般属于政策性调整而不予以特别规定，一旦发生调整，在结算审计时需要注意两个问题。
1、预付款。预付款指开工前发包人应预付给承包人用于为合同工程施工准备的款项。施工准备事项包括购置材料、工程设备、施工设备、修建临时设施以及组织施工队伍进场等。预付款比例一般不低于合同金额的10％，不高于合同金额的30％。
2、进度款。进度款指施工期间发包人根据工程完成情况应支付给承包人的一种工程价款。在工程实践中，发包人同意支付进度一般为合同价的70％，进度款有三种支付方式：一是按形象进度分阶段支付；二是按照已完工程量分期间支付；三是按照阶段及期间混合支付。
3、结算款。结算款，即竣工结算款，指工程竣工结算后发包人应该支付给承包人的除质保金外的剩余工程价款。竣工结算款等于竣工结算价减去质保金和已付款后的金额。竣工结算款支付的前提条件是工程竣工验收合格。
工程款属于纳税的范围，因此工程款也是需要纳税的建筑工程款税分为营业税、城建税、教育费附加、印花税这些，分别的税率如下：
1、营业税：按工程结算款计算缴纳营业税，营业税税率3％。
2、城建税：按营业税计算缴纳城建税，城建税税率：纳税人所在地在市区的，税率为7％；纳税人所在地在县城、镇的，税率为5％；纳税人所在地不在市区、县城、镇的，税率为1％。
3、教育费附加：按营业税计算缴纳，税率3％。
4、印花税：按建筑安装工程承包合同金额的0.3%计算缴纳。
根据法律规定可以得知，工程变更发生后，承包商应在14天内提出工期及费用的增加，进行工程变更价款调整。以上便是小编为您带来关于工程变更价款调整的方法的相关知识，若大家有什么不了解的亦或是有其他疑问的可以咨询的律师。
