理解违法所得和非法财物可以从二者的概念进行区分，前者包括了资金和实物，是使用违法方式获得的财产，后者则是使用非法资金购置的财产。行政机关没收违法所得的计算应当查证属实，根据实际情况进行计算。
违法所得和非法财物的理解为：
1.违法所得是使用违法方式获得的财产，包括资金和实物。
2.非法财物则是指使用非法资金购置的财产。
根据《行政处罚法》的解释，“非法财物”是指违法行为人所占有的违禁品和实施违法行为的工具、物品，不包括加工、生产的产品和经营的商品。这些财物可能原本属于违法行为人的合法财产，因违法行为而转化为非法财产。如未取得烟草专卖生产企业许可证的企业在无证生产过程中使用的生产机械、工具、原料、掺杂掺假的物品等等。
要准确计算违法所得数额，首先必须弄清违法所得与相关概念的区别，以免计算错误；其次，应该是查证属实的违法财物，故调查取证应该全面准确。
瑞律提醒，计算违法所得时，不能凭主观印象，必须查证属实。违法所得的调查取证应当坚持“全面调查、客观公正”的原则。要全面收集与违法所得相关的一切证据，认真听取当事人的意见和陈述，忠于事实真相，排除个人情感和外界因素的干扰。对于收集到的各类证据，包括书证、物证、证人证言、视听资料、当事人陈述、鉴定结论、勘测记录和现场记录都必须经过查证核实。在实际工作中特别要注意现场检查笔录、询问笔录的制作和原始材料收集保存。
根据《刑法》第六十四条之规定，对相关财物的处理有追缴，责令退赔，返还，没收，上缴国库这几种方式。
1.追缴。对于犯罪分子的违法犯罪所得尚存的情况，侦查机关和公诉机关在案件侦查、审查起诉过程中，就应当随时予以追缴，这既是为保障诉讼程序的顺利进行，因为原物也是证据，也是为保障审判结果的顺利实现，法院在审理过程中，也应当追缴。
2.责令退赔。在犯罪分子违法所得原物及款项无法追缴的情况下，公安司法机关应责令犯罪分子退赔。
3.返还被害人或没收、上缴国库。
