分公司因为领取营业执照，并办理了税务登记，因此是一个独立的增值税纳税人。分公司应当向其机构所在地的主管税务机关申报纳税。但是分公司不能独立承担民事责任。
法律依据
《《中华人民共和国增值税暂行条例》》第二十二条增值税纳税地点：
（一）固定业户应当向其机构所在地的主管税务机关申报纳税。总机构和分支机构不在同一县（市）的，应当分别向各自所在地的主管税务机关申报纳税；经国务院财政、税务主管部门或者其授权的财政、税务机关批准，可以由总机构汇总向总机构所在地的主管税务机关申报纳税。
（二）固定业户到外县（市）销售货物或者劳务，应当向其机构所在地的主管税务机关报告外出经营事项，并向其机构所在地的主管税务机关申报纳税；未报告的，应当向销售地或者劳务发生地的主管税务机关申报纳税；未向销售地或者劳务发生地的主管税务机关申报纳税的，由其机构所在地的主管税务机关补征税款。
（三）非固定业户销售货物或者劳务，应当向销售地或者劳务发生地的主管税务机关申报纳税。
