食品卫生经营许可证办理流程需要当事企业的法定代表人或者负责人持有公司章程规定或任命文件、企业生产经营的土地使用证明和平面图到有关部门进行申请办证。
食品卫生经营许可证办理流程是：
1.法定代表人或者负责人资格证明（董事会决议、章程或任命文件）一份（依据京卫疾控字[2002]71号《北京市食品卫生许可证发放管理办法》）;
2.生产经营场地场所的使用证明（房屋产权证明或租赁协议）（依据同上）;
3.生产经营场所场地平面布局图二份。应标明比例尺（比例为1：100）、室内各功能用房，基本要素（尺寸、名称、设施名称及个数），可自行手绘或用电脑绘制（依据同上）;
4.生产经营场所地址方位示意图二份。应标明方向、街道名称、生产经营场所所在位置与周围建筑、相邻单位的关系（依据同上）;
5.卫生许可证申请书三份。申请单位名称写明全称或法定简称，加盖公章（与营业执照申请单位名称一致。个人不盖章）。单位地址、使用面积、卫生设施按实际情况填写详细，申请许可项目填写生产经营范围和种类，空格处以“无”字填写（依据同上）;
6.建设项目卫生审查申请书一份。“项目类别”一栏填写新建、改建、扩建、还是续建，空格处以“无”字填写（依据同上）;
7.餐饮企业应有企业卫生管理制度（依据同上）;
一般时间为10个工作日。
在我国，《中华人民共和国食品安全法》的规定，食品生产经营企业和食品商贩，必须先取得卫生许可证，方可向工商行政管理部门申请登记或者变更登记。卫生许可证的发放管理方法由省、自治区、直辖市人民政府卫生行政部门规定。
2018年6月1日起，北京西城区食药监局持续推动简政放权，进一步压缩行政许可和备案等事项办理条件、审批程序和时限。食品经营许可证核发由原来的20个工作日压缩为5个工作日。
根据《食品安全法》和国家工商总局的有关规定，工商部门负责《食品流通许可证》的发放，凡从事食品流通经营活动，都应到工商部门申领《食品流通许可证》，不需再到卫生部门办理《食品卫生许可证》。经营者应当填写申请表，向许可证受理窗口提交下列有关材料：经营者本人持身份证到当地工商行政管理部门审查，经工商行政管理部门审查批准，商务部应出具预先核准名称的通知。
